英訳が間違っていたら正してください。
彼が父親を殺した別館は、今月末に取り壊される予定です。
The annex which he killed his father is scheduled to be demolished at the end of this month.
答え
whichをin whichかwhereにする
whichに続くhe killed his fatherは文として完成しているので関係代名詞は使えない。
The annex is scheduled to be demolished at the end of this month.
he killed his father in the annex[there]
という意味関係